| Notas: | Índice Introducción 1. MÉTODOS FENOTÍPICOS Y GENOTÍPICOS 1.1. Métodos Fenotípicos 1.2. Métodos Genotípicos 2. REACCIÓN EN CADENA DE LA POLIMERASA – PCR 2.1. Generalidades del ADN 2.2. Ciclo de amplificación 2.3. Parámetros que afectan la PCR 2.4. Infraestructura y contaminaciones 2.5. Cebadores o primers universales y específicos 2.6. Electroforesis y geles de agarosa 3. VARIANTES DE PCR 3.1. PCR Múltiple 3.2. RAPD-PCR 3.3. REP-PCR 3.4. PCR anidada 3.5. PCR - In situ 3.6. PCR digital 3.7. LAMP - PCR 3.8. Real Time PCR 3.8.1. Etapas en Real Time PCR 4. ENZIMAS DE RESTRICCIÓN 4.2. Nomenclatura 4.3. Componentes de una reacción de restricción 4.4. Condiciones a tener en cuenta al trabajar con enzimas de restricción 4.5. Cómo seleccionar la enzima de restricción correcta 5. EPIDEMIOLOGÍA: ELECTROFORESIS DE CAMPOS PULSANTE (PFGE) 5.1. Etapas de la electroforesis en campo pulsante (PFGE) 5.2. Componentes de un sistema de PFGE 5.3. Patrón de PM 5.4. Variables que afectan a la resolución de PFGE 5.5. Inconvenientes de la técnica 5.6. Interpretación de los resultados 6. TRANSFERENCIA DE ÁCIDOS NUCLEICOS A SOPORTES SÓLIDOS 6.1. Tipos de marcación 6.2. Southern Blot 6.3. Northern Blot 6.4. Western Blot 7. SECUENCIACIÓN 7.1. Primeros métodos de secuenciación 7.2. Tecnologías de segunda generación 7.3. Ion Torrent 7.4. Pirosecuenciación 7.5. Flujo de trabajo de NGS 7.5.1. Preparación de bibliotecas genómicas 7.5.2. Enriquecimiento del blanco 7.5.3. Amplificación del templado y secuenciación masiva paralela 7.5.4. Procesamiento de datos 7.6. Tecnologías de tercera generación 7.7. PacBio 7.8. Nanopore 8. REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS ANEXO I: PROTOCOLOS DE TRABAJO I. EXTRACCIÓN DE ADN CROMOSOMAL A PARTIR DE BACTERIAS GRAM POSITIVAS II. EXTRACCIÓN DE ARN TOTAL CON TRIZOL III. EXTRACCIÓN DE PLÁSMIDOS A PARTIR DE BACTERIAS GRAM NEGATIVAS IV. REACCIÓN CONVENCIONAL DE PCR DE PUNTO FINAL V. REACCIÓN DE PCR EN TIEMPO REAL VI. ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA VII. REACCIÓN DE DIGESTIÓN ENZIMÁTICA VIII. ELECTROFORESIS EN CAMPOS PULSANTES ANEXO II: SOLUCIONES DE TRABAJO |
|---|