Monitoreo de la circulación de virus respiratorios en el período inter-olas de sars-Cov-2 en el contexto de la pandemia de Covid-19

Trabajo Integrador Final (Especialista en Virología) - - Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas, 2024.

Detalles Bibliográficos
Autor principal: Scheffer, Jessica Noelia
Otros Autores: Castro, Gonzalo
Formato: doctoralThesis
Lenguaje:Español
Publicado: 2024
Materias:
Covid 19
Virología
Enfermedades Respiratorias
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/11086/553996
Aporte de:
Repositorio Digital Universitario (UNC) de Universidad Nacional de Córdoba
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spelling I10-R141-11086-5539962024-10-19T06:24:55Z Monitoreo de la circulación de virus respiratorios en el período inter-olas de sars-Cov-2 en el contexto de la pandemia de Covid-19 Scheffer, Jessica Noelia Castro, Gonzalo Masachessi, Gisela Sicilia Don, Paola E. Nates, Silvia Viviana Barbás, María G. Isa, María Beatriz Ferreyra, Leonardo Covid 19 Virología Enfermedades Respiratorias Trabajo Integrador Final (Especialista en Virología) - - Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas, 2024. Fil: Scheffer, Jessica Noelia. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Virología "Dr. JM Vanella"; Argentina. Las infecciones respiratorias agudas constituyen una importante causa de morbimortalidad, fundamentalmente en niños menores de 5 años, en personas mayores de 65 años y en individuos que presentan comorbilidades. Si bien los algoritmos nacionales de vigilancia de virus respiratorios del año 2020 sugerían iniciar el diagnóstico diferencial para virus influenza, la contingencia por SARS-CoV-2 dirigió los esfuerzos a la detección activa de casos de COVID-19, generando un déficit en la vigilancia de otros virus respiratorios. El objetivo del presente trabajo fue monitorear la circulación de virus respiratorios en el periodo inter-olas de SARS-CoV-2 en el contexto de la pandemia de COVID-19. Se seleccionaron muestras de aspirado nasofaríngeo (ANF) e hisopado orofaríngeo (HOF) de pacientes pediátricos y adultos, respectivamente, con resultado negativo para SARS-CoV-2, tomadas en los periodos inter-olas de COVID-19 (julio-agosto y octubre-noviembre de 2021). La extracción de ácidos nucleicos se realizó en plataforma automatizada y la detección de los diferentes agentes virales (Influenza A y B, RSV, PIV, hMPV, HAdV y HCoV 229E, OC43, HKU y NL63) por PCR en tiempo real utilizando reactivos comerciales. Las muestras positivas para HAdV se secuenciaron para identificar la cepa infectante. Se analizaron 332 muestras: 90 muestras de ANF del periodo julio-agosto y 242 muestras del periodo octubre-noviembre (142 ANF y 100 HOF). En el periodo julio-agosto, 6,7% (6/90) de los pacientes estudiados resultó positivo para alguno de los HCoV estudiados [83,3% (5/6) para OC43 y 16,7% (1/6) para 229E]. En el periodo octubre-noviembre, 21,9% (53/242) de los pacientes estudiados [67,9% (36/53) pediátricos y 32,1% (17/53) adultos] resultó positivo para alguno de los agentes virales estudiados. De los 36 pacientes pediátricos, 18 (50,0%) resultaron positivos para PIV, 9 (25,0%) para RSV, 5 (13,9%) para HAdV, 3 (8,3%) para HCoV OC43 y 1 (2,8%) presentó coinfección HAdV/HCoV OC43. De los 17 pacientes adultos, 7 (41,2%) resultaron positivos para PIV, 6 (35,3%) para HCoV OC43, 3 (17,6%) para HCoV 229E y 1 (5,9%) para RSV. Los signos/síntomas reportados con mayor frecuencia fueron tos y fiebre, odinofagia, dificultad respiratoria, diarrea y vómitos y secreción nasal. En 3/6 muestras positivas para HAdV fue posible definir serotipo y especie, detectando los serotipos 1, 2 y 5 de la especie C. Si bien la notificación de casos de otras infecciones respiratorias en el año 2021 fue afectada por la pandemia de COVID-19, la vigilancia epidemiológica de las IRAs resulta esencial para detectar precozmente el ascenso estacional en el número de casos, la ocurrencia de eventos inusitados, la identificación de los grupos poblacionales afectados, y la frecuencia, distribución y características de los agentes etiológicos responsables de los mismos. 2026-09-30 Fil: Scheffer, Jessica Noelia. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Virología "Dr. JM Vanella"; Argentina. 2024-10-18T19:18:44Z 2024-10-01 doctoralThesis http://hdl.handle.net/11086/553996 spa Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
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