Integración de bases de datos bioinformáticas a la plataforma Multiomix, para mejorar la interpretación de potencíales biomarcadores oncológicos
En el marco de la plataforma Multiomix,que tiene por objetivo acelerar la identificación y validación de biomarcadores en cáncer, el presente trabajo resolvió la necesidad de que los investigadores (usuarios de Multiomix) puedan disponer de información médica y molecular detallada durante la interpr...
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| Lenguaje: | Español |
| Publicado: |
2023
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| Acceso en línea: | http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/162231 |
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I19-R120-10915-1622312024-02-02T20:10:14Z http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/162231 Integración de bases de datos bioinformáticas a la plataforma Multiomix, para mejorar la interpretación de potencíales biomarcadores oncológicos Bebczuk, Franco 2023-12-14 2023 2024-02-02T16:40:16Z Pons, Claudia Fabiana es Informática Bioinformática ingeniería de datos API REST Enriquecimiento de Datos Estudios Omicos Bases de Datos Cáncer En el marco de la plataforma Multiomix,que tiene por objetivo acelerar la identificación y validación de biomarcadores en cáncer, el presente trabajo resolvió la necesidad de que los investigadores (usuarios de Multiomix) puedan disponer de información médica y molecular detallada durante la interpretación de los hallazgos. Esta etapa de interpretación es clave como complemento de los tests estadísticos que ofrece la plataforma. Para abordar este trabajo, se investigaron diferentes bases de datos y aplicaciones bioinformáticas como Gene Ontology, PharmGKB, STRING y Drugbank, para luego realizar la descarga, curación, transformación de la estructura para optimizar los accesos requeridos y exposición de la funcionalidad a través de una API. Asesor profesional: Matías Butti Licenciado en Sistemas Universidad Nacional de La Plata Facultad de Informática Tesis Tesis de grado http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0) application/pdf |
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En el marco de la plataforma Multiomix,que tiene por objetivo acelerar la identificación y validación de biomarcadores en cáncer, el presente trabajo resolvió la necesidad de que los investigadores (usuarios de Multiomix) puedan disponer de información médica y molecular detallada durante la interpretación de los hallazgos. Esta etapa de interpretación es clave como complemento de los tests estadísticos que ofrece la plataforma. Para abordar este trabajo, se investigaron diferentes bases de datos y aplicaciones bioinformáticas como Gene Ontology, PharmGKB, STRING y Drugbank, para luego realizar la descarga, curación, transformación de la estructura para optimizar los accesos requeridos y exposición de la funcionalidad a través de una API. |
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