Diagnóstico molecular de Porphyomonas gingivalis : estandarización del método
El objetivo del presente trabajo fue estandarizar y optimizar la técnica de PCR convencional para detección de Porphyromonas gingivalis ATCC 33277. Material y métodos: Las cepa de P. gingivalis ATCC33227 se sembró en agar Bruella enriquecido con sangre de carnero, suplementado con hemina y vitamina...
Guardado en:
| Autores principales: | , , , |
|---|---|
| Formato: | Artículo |
| Lenguaje: | Español |
| Publicado: |
Círculo Argentino de Odontología
2021
|
| Materias: | |
| Acceso en línea: | http://repositorio.unne.edu.ar/handle/123456789/30688 |
| Aporte de: |
| id |
I48-R184-123456789-30688 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
I48-R184-123456789-306882024-12-16T11:52:30Z Diagnóstico molecular de Porphyomonas gingivalis : estandarización del método Molecular diagnosis of Porphyromonas gingivalis : standardization of the method Britos, María Rosenda Sin, Cynthya Solange Ortega, Silvia Mercedes Vasek, Olga Myriam Estandarización PCR Porphyromonas gingivalis ATCC 33277 El objetivo del presente trabajo fue estandarizar y optimizar la técnica de PCR convencional para detección de Porphyromonas gingivalis ATCC 33277. Material y métodos: Las cepa de P. gingivalis ATCC33227 se sembró en agar Bruella enriquecido con sangre de carnero, suplementado con hemina y vitamina K. El ADN se extrajo empleando el protocolo que emplea bromuro de cetil trimetilamonio (CTAB). Se evaluó la cantidad y calidad del material genético obtenido con el fotómetro UV Ampli-Quat, AQ-07 Nucleic Acid. Se realizó la PCR convencional con diferentes concentraciones de MgCl2 1 mM, 1,5 mM y 2.0 mM y a dos temperaturas de alineamiento: 60°C y 55°C. Los productos PCR se separaron por electroforesis en un gel de agarosa 1% Las bandas se visualizaron en un fotodocumentador. La sensibilidad se calculó teniendo en cuenta el número de bacterias en diferentes diluciones. Resultados: Se obtuvo una concentración 1,55x106 ng/ul de DNA genómico a partir de una suspensión bacteriana de 108 células bacterianas/ml, con índice de pureza 1,648 (relación de OD260/OD280). Los mejores resultadosse obtuvieron con una concentración de 2 mM de MgCl2 y una temperatura de alineación de 55°C. En cuanto a la sensibilidad se obtuvo un límite de detección de 5 x 10 / 5 µL células bacterianas en suspensión. Conclusión: En la prueba de PCR convencional para Porphyromonas gingivalis ATCC 33277, las condiciones óptimas de estandarización son la concentración de 2 mM de MgCl y 55°C y es necesario una carga bacteriana mínima de 5 x 10 células/5 ul como límite de detección. The objective of the present work was to standardize and optimize the conventional PCR technique for detection of Porphyromonas gingivalis ATCC 33277. Material and methods: P. gingivalis strain ATCC33227 was planted on Bruella agar enriched with sheep's blood supplemented with hemin and Vitamin K DNA was extracted using the protocol using cetyl trimethylammonium bromide (CTAB). The quantity and quality of the genetic material obtained with the UV Ampli-Quat photometer, AQ-07 Nucleic Acid. Conventional PCR was performed with different concentrations of 1 mM MgCl 2, 1.5 mM and 2.0 mM and at two alignment temperatures: 60°C and 55°C. PCR products were separated by electrophoresis on a 1% agarose gel. The bands were visualized in a photodocumentator. Sensitivity was calculated by taking into account the number of bacteria in different dilutions. Results: A concentration of 1.55x106 ng / ul genomic DNA was obtained from a bacterial suspension of 108 bacterial cells / ml, with purity index 1.648 (OD260 / OD280 ratio). The best results were obtained with a concentration of 2 mM MgCl2 and an alignment temperature of 55°C. Regarding sensitivity, a limit of detection of 5 x 10/5 μL bacterial cells in suspension was obtained. Conclusion: In the standard PCR test for Porphyromonas gingivalis ATCC 33277 the optimum standardization conditions are the concentration of 2 mM MgCl and 55°C and a minimum bacterial load of 5 x 10 cells / 5 ul as detection limit is required. 2021-12-30T14:30:59Z 2021-12-30T14:30:59Z 2017-11 Artículo Britos, María Rosenda, et al., 2017. Diagnóstico molecular de Porphyomonas gingivalis: estandarización del método. Revista del Círculo Argentino de Odontología. Buenos Aires: Círculo Argentino de Odontología, vol. 75, no. 225, p. 15-18. ISSN 0325-7479. 0325-7479 http://repositorio.unne.edu.ar/handle/123456789/30688 spa openAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/ application/pdf application/pdf Círculo Argentino de Odontología Revista del Círculo Argentino de Odontología, vol. LXXV, no. 225, p. 15-18. |
| institution |
Universidad Nacional del Nordeste |
| institution_str |
I-48 |
| repository_str |
R-184 |
| collection |
RIUNNE - Repositorio Institucional de la Universidad Nacional del Nordeste (UNNE) |
| language |
Español |
| topic |
Estandarización PCR Porphyromonas gingivalis ATCC 33277 |
| spellingShingle |
Estandarización PCR Porphyromonas gingivalis ATCC 33277 Britos, María Rosenda Sin, Cynthya Solange Ortega, Silvia Mercedes Vasek, Olga Myriam Diagnóstico molecular de Porphyomonas gingivalis : estandarización del método |
| topic_facet |
Estandarización PCR Porphyromonas gingivalis ATCC 33277 |
| description |
El objetivo del presente trabajo fue estandarizar y optimizar la técnica de PCR convencional para detección de Porphyromonas gingivalis ATCC 33277.
Material y métodos: Las cepa de P. gingivalis ATCC33227 se sembró en agar Bruella enriquecido con sangre de carnero, suplementado con hemina y vitamina K. El ADN se extrajo empleando el protocolo que emplea bromuro de cetil trimetilamonio (CTAB). Se evaluó la cantidad y calidad del material genético obtenido con el fotómetro UV Ampli-Quat, AQ-07 Nucleic Acid.
Se realizó la PCR convencional con diferentes concentraciones de MgCl2 1 mM, 1,5 mM y 2.0 mM y a dos temperaturas de alineamiento: 60°C y 55°C. Los productos PCR se separaron por electroforesis en un gel de agarosa 1% Las bandas se visualizaron en un fotodocumentador.
La sensibilidad se calculó teniendo en cuenta el número de bacterias en diferentes diluciones.
Resultados: Se obtuvo una concentración 1,55x106 ng/ul de DNA genómico a partir de una suspensión bacteriana de 108 células bacterianas/ml, con índice de pureza 1,648 (relación de OD260/OD280). Los mejores resultadosse obtuvieron con una concentración de 2 mM de MgCl2 y una temperatura de alineación de 55°C. En cuanto a la sensibilidad se obtuvo un límite de detección de 5 x 10 / 5 µL células bacterianas en suspensión.
Conclusión: En la prueba de PCR convencional para Porphyromonas gingivalis ATCC 33277, las condiciones óptimas de estandarización son la concentración de 2 mM de MgCl y 55°C y es necesario una carga bacteriana mínima de 5 x 10 células/5 ul como límite de detección. |
| format |
Artículo |
| author |
Britos, María Rosenda Sin, Cynthya Solange Ortega, Silvia Mercedes Vasek, Olga Myriam |
| author_facet |
Britos, María Rosenda Sin, Cynthya Solange Ortega, Silvia Mercedes Vasek, Olga Myriam |
| author_sort |
Britos, María Rosenda |
| title |
Diagnóstico molecular de Porphyomonas gingivalis : estandarización del método |
| title_short |
Diagnóstico molecular de Porphyomonas gingivalis : estandarización del método |
| title_full |
Diagnóstico molecular de Porphyomonas gingivalis : estandarización del método |
| title_fullStr |
Diagnóstico molecular de Porphyomonas gingivalis : estandarización del método |
| title_full_unstemmed |
Diagnóstico molecular de Porphyomonas gingivalis : estandarización del método |
| title_sort |
diagnóstico molecular de porphyomonas gingivalis : estandarización del método |
| publisher |
Círculo Argentino de Odontología |
| publishDate |
2021 |
| url |
http://repositorio.unne.edu.ar/handle/123456789/30688 |
| work_keys_str_mv |
AT britosmariarosenda diagnosticomoleculardeporphyomonasgingivalisestandarizaciondelmetodo AT sincynthyasolange diagnosticomoleculardeporphyomonasgingivalisestandarizaciondelmetodo AT ortegasilviamercedes diagnosticomoleculardeporphyomonasgingivalisestandarizaciondelmetodo AT vasekolgamyriam diagnosticomoleculardeporphyomonasgingivalisestandarizaciondelmetodo AT britosmariarosenda moleculardiagnosisofporphyromonasgingivalisstandardizationofthemethod AT sincynthyasolange moleculardiagnosisofporphyromonasgingivalisstandardizationofthemethod AT ortegasilviamercedes moleculardiagnosisofporphyromonasgingivalisstandardizationofthemethod AT vasekolgamyriam moleculardiagnosisofporphyromonasgingivalisstandardizationofthemethod |
| _version_ |
1832345850816233472 |