Methodology proposal for isolating fungi from Manihot esculenta Crantz storage roots with rot symptoms

Fil: Madrassi, Lucas M. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biotecnología Molecular. Instituto de Biotecnología Misiones “Dra. María Ebe Reca”; Argentina.

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Detalles Bibliográficos
Autores principales: Madrassi, Lucas M., Zapata, Pedro Darío, Mónaco, Cecilia I., Alvarenga, Adriana E.
Formato: Artículo publishedVersion
Lenguaje:Inglés
Publicado: Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas Naturales. Secretaría de Investigación y Posgrado 2025
Materias:
Cassava
Isolation
Microorganisms
Root rot disease
Root sample
Mandioca
Aislamiento
Microorganismos
Pudrición radical
Muestra de raíz
Acceso en línea:https://doi.org/10.36995/j.recyt.2025.43.008
https://hdl.handle.net/20.500.12219/5945
Aporte de:
Repositorio Institucional Digital de la UNaM (RIDUNAM) de Universidad Nacional de Misiones
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spelling I77-R195-20.500.12219-59452025-12-09T15:20:44Z Methodology proposal for isolating fungi from Manihot esculenta Crantz storage roots with rot symptoms Propuesta metodológica para el aislamiento de hongos a partir de raíces almacenadoras de Manihot esculenta Crantz con síntomas de pudrición Madrassi, Lucas M. Zapata, Pedro Darío Mónaco, Cecilia I. Alvarenga, Adriana E. Cassava Isolation Microorganisms Root rot disease Root sample Mandioca Aislamiento Microorganismos Pudrición radical Muestra de raíz Fil: Madrassi, Lucas M. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biotecnología Molecular. Instituto de Biotecnología Misiones “Dra. María Ebe Reca”; Argentina. Fil: Madrassi, Lucas M. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Fil: Zapata, Pedro Dario. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biotecnología Molecular. Instituto de Biotecnología Misiones “Dra. María Ebe Reca”; Argentina. Fil: Zapata, Pedro Darío. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Fil: Mónaco, Cecilia I. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales. Centro de Investigaciones en Fitopatología; Argentina. Fil: Alvarenga, Adriana E. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biotecnología Molecular. Instituto de Biotecnología Misiones “Dra. María Ebe Reca”; Argentina. Fil: Alvarenga, Adriana E. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Cassava (Manihot esculenta Crantz) is a vital staple food for millions of people worldwide, primarily valued for its edible storage roots. However, these roots are vulnerable to Cassava Root Rot Disease (CRRD), often caused by fungal pathogens such as Fusarium, Lasiodiplodia, and Phytophthora. This disease poses a significant threat to food security in tropical and subtropical regions. Accurate microbial identification is essential for understanding CRRD pathology. However, conventional methods for isolating microorganisms from diseased roots—particularly fungi—have limitations. For instance, incomplete surface sterilization can lead to the isolation of non-axenic fungal colonies. To address this issue, we propose a modified methodology that includes a surface particle-removal step and sterility controls to validate its effectiveness. Our method significantly improved the isolation of axenic fungal colonies from CRRD-affected roots compared to traditional techniques across three different culture media. Out of 60 samples per method, the proposed method yielded a statistically higher proportion of axenic fungal colonies (88.3%) than the traditional approach (30%). Although the proposed method facilitates microbial isolation, further validation is needed to assess its reliability across various pathogens and environmental conditions. La mandioca (Manihot esculenta Crantz) es un alimento básico para millones de personas en todo el mundo, principalmente debido a sus raíces almacenadoras comestibles. Sin embargo, dichas raíces son susceptibles a la Pudrición Radical de la Mandioca (PRM), enfermedad causada frecuentemente por hongos (Fusarium, Lasiodiplodia o Phytophthora), que es una amenaza para la seguridad alimentaria en regiones tropicales y subtropicales. Una identificación precisa de los microorganismos involucrados es fundamental para mejor comprensión de la PRM. En este sentido, los métodos convencionales de aislamiento de microorganismos a partir de raíces enfermas, en particular hongos, presentan ciertas limitaciones. Por ejemplo, una incompleta esterilización superficial de las muestras puede conducir al aislamiento de colonias fúngicas no axénicas. En este trabajo, se propone una metodología modificada, que incorpora un paso de remoción de partículas superficiales y controles de esterilidad que permiten validar la eficacia de esta etapa. Nuestro método mejoró significativamente el aislamiento de colonias fúngicas axénicas a partir de raíces con síntomas de PRM en comparación con las técnicas tradicionales en tres medios de cultivo distintos. De 60 muestras procesadas por cada método, la metodología propuesta logró un porcentaje estadísticamente superior de colonias fúngicas axénicas (88.3%) en comparación con el enfoque tradicional (30%). A pesar de que el método propuesto facilitó el aislamiento microbiológico, se requiere una validación adicional para evaluar su robustez frente a distintos patógenos y condiciones ambientales. 2025-06-23 info:eu-repo/semantics/article info:ar-repo/semantics/artículo info:eu-repo/semantics/publishedVersion https://doi.org/10.36995/j.recyt.2025.43.008 https://hdl.handle.net/20.500.12219/5945 eng info:eu-repo/semantics/altIdentifier/urn/https://www.fceqyn.unam.edu.ar/recyt/index.php/recyt/article/view/879/903 info:eu-repo/semantics/altIdentifier/urn/https://www.fceqyn.unam.edu.ar/recyt/index.php/recyt/article/view/879/904 info:eu-repo/semantics/openAccess application/pdf application/pdf 3.856 MB Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas Naturales. Secretaría de Investigación y Posgrado

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